В. Д. Ягодина - Определение минимального количества микросателлитных локусов для предварительной оценки популяционно-генетической структуры дальневосточного трепанга Apostichopus japonicus (Selenka, 1867) (Echinodermata: Holothuroidea)

БИОЛОГИЯ МОРЯ, 2025, том 51, № 6, с. 365-374

Определение минимального количества микросателлитных локусов для предварительной оценки популяционно-генетической структуры дальневосточного трепанга Apostichopus japonicus (Selenka, 1867) (Echinodermata: Holothuroidea)

Национальный научный центр морской биологии им. А.В. Жирмунского (ННЦМБ) ДВО РАН, Владивосток 690041, Россия

E-mail:

Проведена оценка минимального количества микросателлитных локусов, необходимых для первичного анализа популяционной структуры на примере выборок дальневосточного трепанга Apostichopus japonicus. Всего было использовано 10 микросателлитных маркeров как максимальное количество, взятое для анализа. На основе средних значений аллельного богатства и F_st для каждого локуса по всем выборкам постепенно убирали по одному маркeру с наименьшими значениями этих показателей и проводили байесовскую кластеризацию с определением параметров для вычисления оптимального количества групп. Показано, что генотипическое распределение особей достигается при девяти локусах в анализе и выше при их ранжировании на основе аллельного богатства и дифференцирующей способности. Стоит отметить, что необходима дальнейшая работа по поиску эффективных молекулярных маркeров для изучения гетерогенности популяции дальневосточного трепанга.

Ключевые слова: Apostichopus japonicus, микросателлиты, популяционная структура, молекулярные маркeры.